A través de las diferentes colecciones exhibidas se va conformando el relato sobre la historia de las culturas prehispánicas que habitaron el sector septentrional de  Valle Calchaquí.

Con una antigüedad de 9.000 años aproximadamente, se introduce el relato sobre la época de cazadores y recolectores, posteriormente el nacimiento de las primeras aldeas y el surgimiento de poblaciones con un estimable grado de desarrollo urbano, llegando luego al contacto incaico e hispano indígena.

Simultáneamente a la exhibición de esta muestra permanente, se ejecuta el programa "La Pieza del mes" que tiene como finalidad ampliar la información al público al exhibir piezas del patrimonio que no se encuentran en exhibición permanente.